Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TrabdQ99JY4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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