Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms