Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Apobec3Q99J72 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Apobec3Q99J72 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Apobec3Q99J72 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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