Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms