Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms