Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim7Q923T7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim7Q923T7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim7Q923T7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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