Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1bQ91YK2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms