Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Tdrd3Q91W18 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Tdrd3Q91W18 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Tdrd3Q91W18 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Tdrd3Q91W18 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd3Q91W18 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Tdrd3Q91W18 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tdrd3Q91W18 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tdrd3Q91W18 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tdrd3Q91W18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms