Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms