Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms