Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ApobrQ8VBT6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApobrQ8VBT6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms