Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan8Q8R3G9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms