Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms