Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkl1Q8K4J6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms