Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitrm1Q8K411 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms