Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lrrtm1Q8K377 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lrrtm1Q8K377 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm1Q8K377 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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