Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssh3Q8K330 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssh3Q8K330 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssh3Q8K330 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssh3Q8K330 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms