Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd3Q8K2F0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms