Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fcho1Q8K285 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fcho1Q8K285 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fcho1Q8K285 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fcho1Q8K285 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcho1Q8K285 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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