Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcf3Q8K268 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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