Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms