Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FgbQ8K0E8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FgbQ8K0E8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FgbQ8K0E8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgbQ8K0E8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FgbQ8K0E8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FgbQ8K0E8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FgbQ8K0E8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FgbQ8K0E8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms