Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms