Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trip10Q8CJ53 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms