Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms