Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Upp2Q8CGR7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms