Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms