Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms