Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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