Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc28bQ8CEG5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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