Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl11Q8CE33 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms