Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Fam228aQ8CDW1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Fam228aQ8CDW1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam228aQ8CDW1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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