Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms