Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A430089I19RikQ8C9W1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A430089I19RikQ8C9W1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms