Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Atg4aQ8C9S8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4aQ8C9S8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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