Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms