Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms