Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C1R3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms