Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms