Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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