Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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