Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms