Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp398Q8BV16 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp398Q8BV16 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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