Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms