Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cnpy4Q8BQ47 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnpy4Q8BQ47 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms