Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms