Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms