Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms