Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms