Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms